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从20世纪80年代初担任国务院办公厅调研室副组长至今，二十几年的时间里，楼继伟先后任职上海体改办副主任、国家体改委宏观司司长、贵州省副省长、财政部副部长等职，几乎亲历了中国改革开放的全过程，长期保持着对宏观经济与财政、货币政策的关注。楼继伟因此成为中国官员中为数不多的涉猎过宏观调控、地方政府和经济职能部门的学者型官员。
曾经发表过《摆脱我国目前通胀困扰的思路选择》、《中国经济发展中亟待解决的改革问题》、《管住货币，改善调控》、《中央银行货币政策工具的改革与国债市场发展》和《经济体制改革中财政的重要性》等文，楼不仅是一名财政学专家，在金融领域也颇有建树，有业内人评价说。
1992年2月到1995年7月国家体改委宏观司司长，期间参与设计了影响深远的1994年税制改革，在提高国民收入、加强中央政府对省级政府的控制方面做出了贡献，他还是当时外汇管理体制改革的牵头人；1998年，朱镕基组建新一届政府，楼继伟从贵州省副省长任上回京担任财政部副部长。
海外媒体称，会说英语的楼继伟与其他几位年轻的经济学家在20世纪90年代协助设计和部署了中国的金融改革。
金融改革屡有建言
他在金融改革方面屡有建言。
在2004年1月中、建两行刚获注资后不久，楼继伟就曾称：“免费的午餐，国有银行已经吃了好几回了，这次注资将是最后的一回。两家银行股份制改造试点，除了实施财务重组外，更为突出的是要加快银行内部的改革。因为，仅仅靠国家支持，不能从根本上解国有商业银行的问题。”
2005年上半年，人民币汇率体制改革还没有推进之时，楼继伟还曾告诫称，中国的金融市场很少提供外汇避险工具，而中国的企业也已经习惯了在固定汇率下的经营。在这种情况下如果开始对汇率实行浮动，中国的企业很可能会因此而交学费。在汇率体制改革推进以后，实际上建设更加完善的外汇市场，为企业提供更多的外汇避险工具，正是改革之上的改革。
2005年6月4日，楼继伟在出席上海国家会计学院第十届SNAI论坛时指出，我国股市必须进行结构性调整，“如果内地股市丧失了基本功能，与香港、东京的股市相比，将有边缘化的危险。中国的好企业选择去海外上市，内地股市没有了好的产品，就不可能正常。如何调整，需要有大智慧。”他同时着重提出了资产证券化的发展方向，“国债、国库券、企业债，只要有足够的现金流，都可以证券化。”
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